Военно-медицинский факультет является высшим военно-образовательным учреждением по подготовке офицеров медицинской службы, офицеров медицинской службы резерва и запаса, повышению квалификации и переподготовке медицинского состава Вооруженных Сил Республики Узбекистан.
После окончания 4 курса лечебного факультета студенты могут продолжить обучение на данном факультете. Продолжительность обучения 2 года и повышение квалификации от одного месяца до года.